Bad Honnef  liegt am östlichen Rhein-Ufer im Süden Nordrhein-Westfalens und mit dem Siebengebirge am Beginn des Rheinischen Schiefergebirges. 

Die Stadt liegt am nördlichen Ausläufer des Westerwalds direkt an der Grenze zum Landkreis Neuwied in Rheinland-Pfalz. Die Stadt liegt etwa 8 Kilometer südlich der Bundesstadt Bonn die durch die dort ansässigen Bundesministerien, -behörden, internationalen Organisationen wie den Vereinten Nationen einen Arbeitsplatzschwerpunkt mit erheblicher nationaler und internationaler Ausstrahlung darstellt. In den letzten Jahren hat sich die ehemalige Kurstadt zu einer wichtigen Tagungs- und Kongressstadt entwickelt.

Zur Bekanntheit beigetragen hat auch Konrad Adenauer, der erste Bundeskanzler der Bundesrepublik Deutschland, der bis zu seinem Tod im Jahr 1967 seinen Wohnsitz im Stadtteil Rhöndorf hatte.

Das 48,3 Quadratkilometer große Stadtgebiet umfasst den südlichen Teil des auch als Naherholungsgebiet genutzten Siebengebirges sowie das östlich davon liegende Gebiet.
Die höchste Erhebung im Stadtgebiet ist mit 455 m ü. NN die Löwenburg, der tiefste Bodenpunkt befindet sich mit 55 Metern am Rheinufer in Rhöndorf. Die Stadtmitte liegt bereits bei 70 m ü. NN.

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